MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-5

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012128	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012128	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012128	AGG	2	6	2590	2595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012128	AT	3	6	4553	4558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012128	CAA	2	6	4559	4564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012128	TA	3	6	4569	4574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012128	AG	3	6	7799	7804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012128	A	6	6	9218	9223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012128	AATTC	2	10	9241	9250	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_012128	T	6	6	9273	9278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012128	TA	3	6	9299	9304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012128	AT	3	6	9305	9310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012128	AAAGC	2	10	10151	10160	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012128	AAT	2	6	10617	10622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012128	ACA	2	6	10654	10659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012128	TTA	3	9	10753	10761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012128	A	6	6	10784	10789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012128	C	6	6	11295	11300	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_012128	ATC	2	6	11563	11568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012128	AGT	2	6	12074	12079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012128	T	6	6	12105	12110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012128	CCT	2	6	12353	12358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_012128	TA	3	6	12379	12384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012128	T	6	6	12406	12411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012128	A	7	7	12426	12432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012128	TTACA	2	10	12479	12488	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_012128	T	6	6	12489	12494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012128	TAA	2	6	12505	12510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012128	AAC	2	6	12536	12541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012128	TGTAG	2	10	12551	12560	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012128	TAAAAT	2	12	12568	12579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012128	ATTT	2	8	12582	12589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012128	ATTAA	2	10	12611	12620	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012128	TAA	2	6	12627	12632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012128	TTTAA	2	10	12633	12642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012128	T	7	7	12645	12651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012128	ATTAT	2	10	12685	12694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012128	ATT	3	9	12697	12705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012128	AGG	2	6	12716	12721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012128	T	8	8	15144	15151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012128	A	6	6	15156	15161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012128	A	8	8	15175	15182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012128	AAT	2	6	16071	16076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012128	T	6	6	16083	16088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012128	ATT	2	6	16097	16102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012128	TGG	2	6	16110	16115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012128	TAT	2	6	16117	16122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012128	AAG	2	6	16124	16129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012128	T	6	6	16174	16179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012128	T	7	7	16203	16209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012128	TAAA	2	8	16236	16243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012128	ATTTA	2	10	16249	16258	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012128	ATT	2	6	16263	16268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012128	TTA	2	6	16270	16275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012128	AAAT	2	8	16276	16283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012128	TTA	2	6	16307	16312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012128	TAA	2	6	16333	16338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012128	T	8	8	16347	16354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012128	TA	5	10	16399	16408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012128	TAT	2	6	16424	16429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012128	TAAA	2	8	16431	16438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012128	ATTTA	2	10	16448	16457	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012128	T	6	6	16474	16479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012128	T	7	7	16506	16512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012128	A	6	6	16527	16532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012128	ATT	2	6	16560	16565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012128	TCTA	2	8	16568	16575	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012128	AGG	2	6	16580	16585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012128	TAAAAA	2	12	17935	17946	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012128	A	7	7	17942	17948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012128	A	7	7	17951	17957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012128	AGG	2	6	17969	17974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012128	AAGTAA	2	12	19225	19236	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012128	TA	3	6	19286	19291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012128	TC	3	6	19293	19298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012128	TGCA	2	8	19301	19308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012128	GTG	2	6	19344	19349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012128	AAGA	2	8	19369	19376	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012128	AT	3	6	19393	19398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012128	AATTT	2	10	19413	19422	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012128	GA	3	6	19468	19473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012128	ATTA	2	8	19537	19544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012128	A	6	6	19556	19561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012128	TA	3	6	19565	19570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012128	A	6	6	21006	21011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012128	T	6	6	21033	21038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012128	AT	3	6	21039	21044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012128	TAAG	2	8	21337	21344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012128	TAA	2	6	21368	21373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012128	GATA	2	8	21397	21404	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012128	AAG	2	6	21407	21412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012128	TAT	2	6	21447	21452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012128	AGA	2	6	22251	22256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012128	GTG	2	6	22266	22271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012128	TTA	2	6	22311	22316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012128	TTTAA	2	10	22321	22330	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.